李舜臣准备率领12艘仅存战舰迎战日军。经过会议讨论，李舜臣决定利用鸣梁的地形歼灭日军。鸣梁海战李舜臣击退了日本水军。在日军军营，宇喜多秀家准备继续进军全罗道，却得到了水军战败的消息，无奈只能退回庆尚道。

　　在日本京都，丰臣秀吉不满前线日军的战果，准备亲征朝鲜，却吐血倒地。在朝鲜，杨镐提出对蔚山的岛山城进行攻击。朝鲜群臣赞同，唯独柳成龙表示担忧，决定与杨镐同去蔚山。北人党担心柳成龙通过此战获得民心，而李山海斥责了李尔瞻不顾战乱只顾党争的想法。可是李山海真正的用意却是想让柳成龙功高盖主令宣祖不满。

　　岛山城之战，加藤清正遭到明军围攻。军粮用尽后，加藤只能杀马充粮。日军坚守不降，明军攻不下来。此时又传来日军援军过来的消息，杨镐不顾柳成龙的反对执意要率领明军撤退。不料杨镐却谎报岛山大捷，还大摆庆功宴。因此明朝朝廷派来使臣将杨镐抓走。消息传到朝鲜朝廷，宣祖打算派奏请使去明朝把杨镐救回朝鲜。

　　柳成龙不愿意担任奏请使救回杨镐，希望朝廷能支持新任经理丁应泰。柳成龙抗命不遵，引起了朝鲜君臣的一致不满。北人党打算利用这个机会把柳成龙搞下台，并污蔑柳成龙与日本议和。柳成龙与李山海会面，希望北人在战乱结束前不要再党争了，并表示自己在战乱结束后会主动下台的。

　　李山海指出宣祖才是幕后真正的主使。李德馨恳求宣祖不要抛弃柳成龙。在日本，丰臣秀吉病重而亡，临死前下令撤军。小西行长认为只要有李舜臣在就不会平安撤军。在朝鲜，宣祖下令对日军进行总攻击。

　　李舜臣要水军做好准备歼灭逃走的日军。宗义智贿赂明朝水军都督陈璘，希望他能对日军网开一面。加藤清正整军准备撤退，感叹在朝鲜一事无成。

　　宣祖召见王室成员，临海君想当世子被宣祖驳回。宣祖告诉光海君没有明朝诰命就不能称作真正的世子。光海君找李山海，希望北人党能做自己的后盾，并表示支持北人党除掉柳成龙。

　　李山海又找尹斗寿，寻得了西人的支持。朝廷众臣集体弹劾柳成龙。金贵人劝宣祖不要抛弃柳成龙，宣祖反而警告金贵人不要和光海君走得太近。尹斗寿来找柳成龙，柳成龙告诉他自己会在战乱结束后退下的。

　　在水军营，陈璘劝李舜臣放过日军，遭到李舜臣的怒斥。小西行长大怒，准备与李舜臣决一死战。李舜臣进行战前动员，希望众将士能把倭贼歼灭殆尽。在露梁，李舜臣率领朝鲜水军迎战胁坂安治的日本水军。

　　陈璘率明朝水军在后方待机。李舜臣率军对日军进行突击。双方激战正酣。宣祖召见柳成龙，两人敞开心扉彻谈。柳成龙主动辞职，而宣祖袒露了自己对君主权力的执着。柳成龙希望宣祖要珍惜对国家忠心的臣子和百姓。

　　露梁海战李舜臣大破日军，日军狼狈不堪。明军也趁势冲上。可惜李舜臣被敌军子弹击中，战死海疆。最终朝鲜水军击败了日军，结束了战争。柳成龙辞官回乡，将七年战争的历史写入了《惩毖录》一书中。