光海君重新安排八道军队抵御日军，并启用了老臣郑琢和败将李镒。柳成龙警告李镒不得再临阵逃跑。金公谅被金贵人安排在光海君身边监视他。光海君在郑琢的协助下来到伊川领导分朝。李舜臣的水军在闲山岛与胁坂安治的水军大战。李舜臣摆出鹤翼阵，包围了胁坂的舰队。

　　李舜臣经过激战击败了胁坂安治。在义州，宣祖气愤光海君擅自把分朝移动到伊川。群臣为光海君求情。宣祖认为这是挑战王权，竟然削夺了分朝所有大臣的官职。光海君想无视宣祖命令，仍然领导分朝大臣。郑琢劝光海君切莫如此。光海君只能磕头认罪。

　　宣祖便饶过了光海君这次。在全罗道，高敬命率七千义兵投奔权栗。权栗指挥官军和义军，防守梨峙和熊峙。权栗最终在梨峙击败了日军，但高敬命在偷袭日军后方时战死。在平壤，面对前有明军后方又不稳，小西行长感到根本无法继续进军，责怪玄苏没有成功和议。同时，小西军中瘟疫流行，伤亡惨重。

　　在咸镜道，加藤清正打算活捉临海君。在日本，丰臣秀吉因为胁坂安治之败而震怒，前田利家劝秀吉饶恕胁坂。秀吉打算亲征朝鲜，命令前田留在日本防备德川家康。此时却传来了秀吉之母大政所夫人去世的消息。在朝鲜，飞击震天雷已经彻底制造完成。

　　李长孙完成了飞击震天雷的制造。在平安道，李元翼催促祖承训尽快出兵平壤，而祖承训却想不战屈人之兵。小西行长打算使用空城计引诱明军。

　　祖承训中计，带兵前往平壤。柳成龙虽然劝阻，但投降日军的平壤百姓依然骗取了祖承训的信任。在平壤城，明军被包围全歼，祖承训逃回明朝。宣祖失望至极。

　　郑琢劝光海君让宣祖内附辽东，被光海君拒绝。在全罗道，胁坂安治九死一生，而李舜臣却担心日军陆军袭来。李舜臣抓住了几个盗窃军粮的逃兵，为肃军纪将他们处斩。柳成龙抓到了投降日军的百姓，得知了平壤城日军的真实情况。宣祖病急乱投医，打算请女真族的努尔哈赤帮忙，被尹斗寿反对。

　　郑澈因此再次与尹斗寿密谋拥立世子登上王位。在明朝，万历帝仍然认为朝鲜与日本同谋，准备派官吏去直接管控朝鲜。在咸镜道，投降日本的朝鲜百姓抓捕了临海君和顺和君两位王子。

　　加藤清正威逼临海君写劝降书。小西行长则与石田三成密谋与明朝议和。在日本，丰臣秀吉祭奠母亲，却意外得知了淀殿怀孕的消息，便不再去朝鲜。

　　前田利家建议派陆军去对付李舜臣。郭再佑围攻妓院，杀死了投降日军的叛徒孔撝谦。